ผลจากการที่บริโภคอาหารที่มีโปรตีนสูงในระยะหนึ่งจะทำให้ ความรู้สึกอยากอาหารลดน้อยลง ร่างกายจะเริ่มนำเอาไขมันมาเผาผลาญให้พลังงานแทนที่คาร์โบไฮเดรตหรือเรียกว่าภาวะ Ketosis  ในภาวะนี้จะทำให้น้ำหนักลดลงแต่ก็มีผลข้างเคียงตามมาคือ ปวดหัว คลื่นไส้ อาเจียน ปวดท้อง หัวใจเต้นเร็ว มีไข้ สับสน อ่อนเพลีย การทำงานของไตผิดปกติเพราะการที่ได้รับโปรตีนสูงไตจะทำงานหนักกว่าเดิมทำให้ไตเสื่อมสภาพได้เร็วขึ้น การที่เน้นการบริโภคแต่เนื้อสัตว์จะทำให้ร่างกายขาดวิตามินและเกลือแร่รวมถึงใยอาหารที่ร่างกายต้องการ เมื่อได้รับโปรตีนสูงร่างกายจะเร่งการขับของแคลเซียมทางปัสสาวะทำให้เกิดปัญหาในผู้ที่บริโภคอาหารโปรตีนสูงเป็นระยะเวลานานจะมีความเสี่ยงต่อการเกิดโรคกระดูกผุ กระดูกพรุนมากกว่าคนปกติ และอีกอย่างที่สำคัญคืออาหารประเภทเนื้อสัตว์จะมีคอเลสเตอรอลอยู่ด้วย หากบริโภคเนื้อสัตว์มากก็มีโอกาสที่จะได้รับปริมาณคอเลสเตอรอลสูงขึ้นตามไปด้วย ดังนั้นจึงไม่ควรบริโภคอาหารที่มีโปรตีนสูงเป็นระยะเวลานาน และถึงแม้ว่าจะเลือกรับประทานโปรตีนมากกว่าอาหารในกลุ่มอื่น แต่ก็ควรเลือกโปรตีนที่ไขมันต่ำและยังคงต้องมีคาร์โบไฮเดรตอยู่ด้วย เนื่องจากร่างกายโดยเฉพาะสมองต้องการน้ำตาลกลูโคสเพื่อใช้เป็นพลังงาน ซึ่งน้ำตาลกลูโคสจะมาจากการเผาผลาญคาร์โบไฮเดรตนั่นเอง หากขาดน้ำตาลกลูโคสก็จะทำให้การทำงานของระบบประสาทและสมองแย่ลง